陳菊也指出，主要公營事業(yè)如中油、臺電，總公司設在臺北、工廠卻設高雄，造成污染留在高雄，營業(yè)稅與營利事業(yè)所得稅卻上繳當局、錢進臺北，高市未蒙其利，每年卻得編列預算降低污染影響。

此外，縣市合并后幅員遼闊，但當局補助比例及額度卻大幅減少10%-20%，許多重大市政建設，如河川防洪、生活圈道路交通系統(tǒng)建設、都會區(qū)鐵路立體化計劃、污水下水道工程、動物保護推動及地方農(nóng)產(chǎn)發(fā)展等皆降低補助，市府只能舉債因應。